吉木萨尔县积极落实《全国科技援疆规划》中县市“科技综合服务中心”建设相关内容，在全国支疆行动办公室的大力支持下，于2015年建成吉木萨尔县科技综合服务中心，围绕“科技服务”，助力县域创新能力建设。
一是搭建科技需求与技术供给服务平台。中心建立了“吉木萨尔县科技创新综合服务平台”网页，共设6大板块13个内容，截止目前已发布各类政策、信息1200多条，为企业提供技术需求、技术转让、技术合作、品牌创建、科技成果转化等信息，实现本地企业资源相互共享，累计为15家中小企业提供服务，企业增加销售收入700多万元，增加就业65余人。
二是开展需求调研落实先进技术转移转化。中心深入35家企业、合作社开展调研55次，了解企业实际需求，提供政策咨询68次，帮助4家企业组建区级工程技术研究中心，4家企业被评为高新技术企业；协助筹建了新疆维吾尔自治区科学发展研究吉木萨尔县分院和昌吉州特色农产品深加工产业技术创新战略联盟。
三是重视知识产权保护提高企业技术创新能力。中心积极宣讲知识产权保护的相关知识开展相关培训，并与两家托管机构签订了知识产权托管协议，共同帮助企业和个人申请专利，保护自主知识产权，截止目前帮助15家企业申请各类专利48件。中心通过调研和建档工作进一步摸清了企业的研发能力，提升了专利申请案源的培育，促进了企业创新能力建设。
四是组织参加各类展会促进企业对外合作交流。为进一步让企业成果面向市场，拓宽企业视野，对传统经营模式进行转轨升级，中心积极组织企业参加科恰会、深圳高交会、农产品交易会等，帮助企业达成技术合作协议。如：在第八届科洽会上帮助新疆天山骄子食品有限责任公司与农业部食品质量监督检验测试中心达成合作，开展“红花牛肉干质量改进技术引进与研究”，通过改进和引进新技术、新工艺，制定出一套便于企业执行的红花牛肉干标准，使产品在无添加剂、防腐剂的情况下储存达到12个月。
五是鼓励企业在项目实施中提升科技创新能力。为进一步加强对科技项目的管理工作，中心积极了解科技项目申报指南要求，鼓励符合条件的企事业单位申报科技项目，严审企事业单位提交申报材料，截止目前累计申报国家、自治区、州科技项目44项，争取项目资金696.6万元。
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